Olá @oziasneto, seja bem-vindo à NuCommunity! 
Infelizmente a CTPS não é aceita como documento válido para o cadastro como pode ser visto neste tópico. 
Os documentos válidos nessa etapa são:
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RG ou CNH originais;
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Carteira de Órgão de Classe (como OAB, CRM, CREA, etc);
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Para estrangeiros: RNE, RNM (Registro Nacional Migratório) ou documentos de identidade emitidos pelo Ministério das Relações Exteriores Brasileiro;
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Passaporte brasileiro original.
Mas acho válido você tentar explicar a sua situação para o Nubank através de um dos canais de atendimento. Por lá acredito que eles consigam te orientar melhor sobre o que pode ser feito.
Boa sorte! 