Veja se ambas possuem tag along de 100%. Compare o preço pelo retorno de ambas.
Se você for peixe pequeno, pegue preferenciais, já que provavelmente está mais interessado nos retornos dos proventos. Se quiser participação em decisões na empresa, ordinárias.
Em resumo: preferencial tem DY geralmente maior. Ordinária tem poder de decisão. Quando ocorre compra em grande escala por outra empresa, geralmente ordinárias podem subir um pouco mais.