@RONAN_MOREIRA_CAETAN e @marcello.dev,
Fui perguntar sobre isso no chat, criei um tópico pra dar mais destaque a essa informação: 
Taxa de custódia do Tesouro Direto - vai sair de onde? - NuInvest - NuCommunity (nubank.com.br)
Mas pra vocês não precisarem ir até lá, o retorno que eu recebi foi de que o valor será cobrado na conta do Nubank.