Olá @Alan94 , boas vindas à NuCommunity! 
Sim, a Conta do Nubank é perfeitamente segura! Eu mesmo mantenho minhas reservas por lá desde a criação da mesma e sigo sem problemas desde então!
Se você deixar o seu dinheiro aplicado em títulos públicos, ele estará separado do patrimônio do Nubank e não pode ser utilizado pela mesma em caso de falência da instituição.
Agora se você ativar o RDB, o seu dinheiro pode ser utilizado pelo Nubank mas ele estará protegido pelo FGC.
Ambas as opções são seguras, então vai mais de você mesmo. Eu mesmo mantenho na opção RDB, pois assim o meu dinheiro aplicado pode ser utilizado pela instituição para o crescimento da mesma, além de estar protegido pelo FGC.
Se você tiver mais do que o teto de reembolso do FGC (R$250 mil por CPF) aplicado, talvez manter em títulos públicos seja mais interessante, já que não existe esse limite de ressarcimento.