Por esse relato, pode ter certeza que o problema está do lado do Mercado Pago.
Com exceção da loterias caixa, nesse site especificamente o Mercado Pago tem problemas com cartões, foi reportado aqui:
Já em relação a outros pagamentos no Mercado Livre, ou mesmo no Mercado Pago com o QR Code, já utilizei sem problemas no McDonalds por exemplo.
Tente gerar um novo cartão virtual e fazer o teste(Menos no site de loteria da caixa)
Se ainda sim tiver problemas, fale com o suporte do Mercado Pago, você pode estar com alguma restrição no sistema de segurança deles.