Oi @ArmandoDS, desejo que você esteja bem. 
É como o @Edvan_Cds e @mladeira disseram, após o pagamento seu limite retornará, mas deve haver o abatimento do valor negativo. 
O limite de crédito só fica negativo porque o banco autorizou, ou teve que autorizar, o uso de limite acima do valor disponível a você, logo, este valor é devido e constará na sua fatura seguinte para pagamento. 
De todo modo, aqui na comunidade somos majoritariamente clientes colaborando uns com os outros com aquilo que sabemos, ou pensamos, e o ideal é que você busque essa informação junto às equipes de atendimento da própria Nu através do chat no App (link abaixo).
https://nuapp.nubank.com.br/bnVhcHA6Ly9jaGF0
Assim terá a informação de quanto será seu limite exato após a quitação desta fatura… 
Tudo de bom a todos nós…
