Se você possui uma conta corrente no Itaú com isenções de tarifa por causa do vínculo com a sua empresa, ao retirar o recebimento do salário de lá você pode ser cobrada pelo Itaú sim.
Verifique com a sua empresa se existe algum acordo do tipo. Se sim, você pode fazer a portabilidade para o Nubank, encerrar esta conta corrente e deixar só a conta salário aberta para fugir dessas tarifas. 