Você só vai estar reduzindo o seu limite dentro do que já tem, mas o limite como um todo segue lá pra quando quiser reajustar para o valor normal, o meu sempre deixo baixo quando não vou consumir muito só para as assinaturas, mas qualquer coisa ajusto pro valor original sem problema algum. 
Exemplo: o seu limite é 1.000 R$, mas você o diminuiu para 500 R$ no App, você pode voltar quando quiser para 1.000 R$.