A partir do dia 12 de Dezembro de 2022, os novos CNPJs MEI não incluem mais o CPF, de acordo com a LGPD (Lei Geral de Proteção de Dados).
Como tenho clientes MEI, entrei em contato para pedir a permissão e fazer a altercação na Razão Social, porque quem emitiu CNPJ anterior a essa data, vai ter que tirar manual.
É importante lembrar que a prefeitura não faz cruzamento de dados, então a modificação deve ser feita diretamente por lá, caso você emita nota fiscal.
Como resolver isso?
Vamos lá, é preciso entra neste site para fazer a alteração contratual 
https://mei.receita.economia.gov.br/alteracao/conclusao
Depois de acessar, você vai marcar as opção lá embaixo e confirmar, pronto o CPF vai sair da Razão Social.